FLATDB


Flatworm Database

Plataforma bioinformática que integra  información existente sobre genómica, transcriptómica y proteómica de platelmintos: Echinococcus spp., Fasciola hepatica, Schistosoma mansoni, Mesocestoides corti

Para acceso a las anotaciones de Echinococcus oligarthrus por favor escribir a: lkamenetzky@gmail.com


Objetivos

  1. Desarrollar una base de datos, FlatDB, que incluya información existente y la generada en esta propuesta, permitiendo integrar datos genómicos, transcriptómicos y proteómicos de platelmintos.
  2. Generar datos nuevos que complementen los datos existentes y contemplen problemáticas de la región: genoma de Echinococcus canadensis (genotipo G7), transcriptoma de Fasciola hepatica y proteoma de E. canadensis (genotipo G7) y Echinococcus ortleppi (genotipo G5).
  3. Identificar genes de importancia para el desarrollo y supervivencia de parásitos platelmintos y analizar su potencial como blancos de drogas.
  4. Integrar herramientas que permitan, en el futuro, evaluar drogas antihelmínticas disponibles en la Red de Investigación Argentina-Brasil-Uruguay.

Funcionamiento


Descargar Grupos de Ortología de Maldonado et al (2017)  –>  click aquí

Citar a:
Maldonado, L.L., Assis, J., Araújo, F.M.G., Salim A.C.M., Macchiaroli N., Cucher M., Camicia F., Fox A., Rosenzvit M., Oliveira G. & Kamenetzky L. The Echinococcus canadensis (G7) genome: a key knowledge of parasitic platyhelminth human diseases. BMC Genomics 18, 204 (2017). https://doi.org/10.1186/s12864-017-3574-0


Contacto:

Dado que es una base en contrucción para acceder a los datos por favor contactar a alguno de los coordinadores:

Coordinador

Centro de Investigación

País

lkamenetzky@fmed.uba.ar

Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPAM)

Argentina

Mara Rosenzvit
mrosenzvit@fmed.uba.ar

Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPAM)

Argentina

Guilherme Oliveira
oliveira@cpqrr.fiocruz.br

Genomics and Computational Biology Group, CPqRR – Oswaldo Cruz Foundation, Belo Horizonte

Brasil

Henrique Bunselmeyer Ferreira henrique@cbiot.ufrgs.br

Centro de Biotecnologia, UFRGS, Porto Alegre

Brasil

 Jose Tort
jtort@fmed.edu.uy

Departamento de Genética, Facultad de Medicina, UDELAR, Montevideo

Uruguay


IMPAM-UBA-CONICET
Facultad de Medicina, Paraguay 2155, Piso 13, CABA, Argentina
Tel. Directo: (+5411) 5285-3533 / 3534


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